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Chargé de Recherche INRAE, HDR Équipe de recherche :  INCCA Courriel :  sophie.brunel-muguet@unicaen.fr   (ou sbmuguet@rennes.inra.fr ) Tél. : +33(0)2 31 56 51 36 Localisation : CAMPUS 1, Bât. J3, Porte IR 068  Adresse : Université de Caen, CS 14032 Esplanade de la paix, 14032 CAEN CEDEX 5.

Activités de recherche :

Mon projet s’inscrit dans un contexte agricole de gestion durable de la fertilité des sols. Il vise à développer une approche de modélisation des flux nutritionnels, i.e. carbonés (C), azotés (N) et soufrés (S) au sein d’une plante architecturée, le colza.

L’approche de modélisation est destinée à (i) établir un cadre d’analyse écophysiologique des flux (prélèvement, utilisation via les processus d’assimilation et de remobilisation) et mécanismes de régulation associés, (ii) prévoir la croissance du végétal et les composantes de rendement dans une large gamme de conditions environnementales (température, rayonnement, disponibilités en N et S) et (iii) identifier des indicateurs de fonctionnement utilisables pour l’analyse variétale ou le pilotage des fertilisations.

L’enjeu de mon projet est d’intégrer ce niveau d’analyse aux échelles de caractérisation plus fines développées dans l’équipe. La première voie d’intégration repose sur l’établissement d’un modèle prédictif « Crop Model » permettant (i) de cibler les variables « plante » les plus influentes sur les performances agronomiques et de (ii) définir les formalismes adaptés aux particularités architecturales du colza et propres au métabolisme S et N. L’identification de ces variables doit permettre de cibler les mécanismes sous jacents qui feront l’objet de caractérisations moléculaires plus poussées. La seconde voie d’intégration est fondée sur l’analyse du déterminisme génétique de ces variables « plante » qui est guidée par des hypothèses sur des mécanismes bien caractérisés aux échelles cellulaires et moléculaires.

 Activités contractuelles associées :

• 2012-2015 : SERAPIS « Optimisation de la fertilisation soufrée : Développement de fertilisants innovants et d’indicateurs de la nutrition soufrée. » Projet labélisé par les pôles de compétitivité Végépolys et Valorial. Porté par TIMAC AGRO INTERNATIONAL (Groupe ROULLIER). Partenaires : Anaximandre, UMR EVA, UMR INRA URLEG, Groupe ESA, Végénov-BBV.
• 2012-2016 : CAQ40 “Climate change and Quality of fruit, grain and seeds in the next 40 years : adaptation to high temperature and water stresses at the end of crop cycle” associé au Méta-programme Adaptation au Changement Climatique de l’Agriculture et de la Forêt (ACCAF). Coordonnateurs: C.Dürr (PMS Angers) et H. Gautier  (PSH Avignon).
• 2012-2020 : RAPSODYN «Optimization of oilseed rape and sunflower oil yield under low input crop management of hybrid varieties» dans le cadre l’AAP Investissement d’Avenir.
   Coordonnateur : N. Nesy (APBV Rennes).

 Encadrement : 

• 2007 : M1 en co-encadrement (F. Pantin et E. Thiery, Master Agrocampus Ouest)
• 2009 : M1 en co-encadrement (A.-L. Saucereau et A. Moizant, Master Science de la terre et environnement, écologie, Faculté de sciences et technologies, Bordeaux 1)
• 2011 : M1 (C. Orieux, Parcours biologie physiologie, Orientation végétale UCBN) et M2 (D. Goudier, Master Génomique et Productivité Végétale, Université Paris Diderot)
• 2012 : M1 (E. Sénécal, Parcours biologie physiologie, Orientation végétale UCBN) et M2 en co-encadrement (C. Orieux, Master R/P EcoBioValo, UBCN)

Dernières publications :

1. Brunel S., Teulat-Merah B., Wagner M.-H., Huguet T., Prosperi J.-M., Dürr C. 2009. Using a model-based framework for analysing genetic diversity during germination and heterotrophic growth of Medicago truncatula. Annals of Botany, 103:1103-1117.
2. Dias P., Brunel-Muguet S., Wagner M.-H., Prosperi J.-M., T.Huguet, Dürr, C., Teulat-Merah B. 2010. QTL analysis of seed germination and pre-emergence growth of Medicago truncatula at extreme temperatures Theoretical and Applied Genetics 122(2):429-44
3. Brunel-Muguet S., Aubertot J.-N.., Dürr C. 2011.  Simulating the impact of genetic diversity of Medicago truncatula on germination and emergence using a crop emergence model for ideotype breeding. In press doi:10.1093/aob/mcr071. Annals of Botany. 107(8): 1367-1376
4. Brunel-MuguetS., Pellerin S., Mollier A. How does early leaf growth response to low Phophorus (P) availability impact on genotypic performances in Zea mays L.?  Soumis à Annals of  Botany (Février 2012).
5. Brunel-Muguet S.,Beauclair P., Bataillé M.-P., Avice J.-C., Trouverie J. Etienne P., Ourry A. Effects of shading on biomass production and N-dynamics in winter oilseed rape (Brassica napus L.). Soumis à The Journal of Plant Physiology (Avril 2012)

Autres publications : UMR-EVA

Activités d'enseignement :

Intervention dans le MASTER SV-ECOBIOVALO UE 3.2 (Veg9) – GlycoBIOLOGIE, PhycoLOGIE & Ecophysiologie - Modélisation du fonctionnement végétal – Intérêts des modèles écophysiologiques et exemples d’applications (2h CM, 4h TD informatiques).

Documents de cours : Télécharger au format zip

Autres activités :

• Membre élue du conseil scientifique du Département Environnement Agronomie (2011-2015)
• Activités de Referee pour Annals of Botany et Plant and Soil
• Animation interne de la thématique transversale « Modélisation des interactions G x E »
• Animation scientifique de l’unité avec J. Trouverie et J.-C. Avice
• Correspondante Formation Permanente INRA-Rennes

Formation antérieure :

• 2001-2004 : Ingénieur Agronome (ENSA Toulouse)
• 2003-2004 : Imperial College (Angleterre)-Spécialisation: Biotechnologies végétales
• 11/2005-12/2008 : Thèse encadrée par C.Dürr-UMR 1191 PMS (Physiologie Moléculaire des Semences) « Caractérisation de la germination et de la croissance hétérotrophe de différents génotypes de Medicago truncatula »
• 01/2009-03/2010 : Post-doctorat encadré par A.Mollier et S.Pellerin- UMR 1220 TCEM (Transfert et Cycle des Eléments minéraux dans les écosystèmes cultivés)  « Identification de mécanismes d’adaptation à de faibles disponibilités en Phosphore chez Zea mays»
• Depuis 04/2010 : Prise de fonction CR2- UMR INRAE-UCBN 950 EVA « Ecophysiologie Végétale et Agronomie, nutritions N, C et S»