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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Génétique & Génomique

Thèmes de l'équipe Génétique et Génomique

Contexte et ambition

Les ressources alimentaires pour l’élevage devenant de plus en plus limitées et objet de concurrence, tout particulièrement avec l’alimentation humaine, l’efficacité alimentaire et les capacités d’adaptation des animaux à des conditions d’alimentation changeantes sont aujourd’hui primordiales. Il est bien établi que ces caractères, jusqu’alors peu « travaillés » par la sélection, sont ceux sur lesquels les retombées potentielles de la sélection génomique seront les plus importantes. Le phénotypage fin et le génotypage à haut débit permettent aujourd’hui de les analyser dans toute leur complexité.

Dans ce contexte, notre ambition est de décrire l’architecture génétique des caractères liés à la constitution et à la mobilisation des réserves énergétiques chez les volailles (poulet et canard) et en particulier au métabolisme des lipides. Nos travaux visent notamment l’amélioration des modèles additifs de prédiction de la valeur génétique des reproducteurs par la prise en compte d’effets d’interaction gènes-gènes ou gènes-environnement. Trois voies d’analyse complémentaires sont mises en œuvre dans une démarche intégrative : l’étude des zones chromosomiques affectant les caractères ; l’étude de l’expression génique au niveau des ARN ; l’exploitation des connaissances disponibles sur les génomes.

Objectifs

  • Cartographier les gènes influençant le stockage, la mobilisation et l’utilisation des réserves énergétiques chez les volailles
  • Analyser la régulation génétique du métabolisme des lipides
  • Participer au développement et à la mise au point des méthodes et outils nécessaires pour atteindre ces objectifs

Expertises et compétences

L’équipe Génétique & Génomique possède une expertise dans les différentes disciplines utiles à l’analyse de la variabilité génétique des caractères : la génétique, quantitative et cellulaire, la biologie moléculaire, la statistique, la bioinformatique et le développement logiciel.

Compétences méthodologiques
  • Cartographie de QTL
  • Analyse du transcriptome et de sa dynamique
  • Modélisation des réseaux de gènes
  • Analyse fonctionnelle du métabolisme des lipides
  • Validation cellulaire des effets de polymorphismes génomiques

L'équipe

Membres de l'équipe Génétique et génomique
Resp. GG
Christian Diot

Responsable équipe "Génétique et génomique"

Tél. : 02 23 48 54 61
Courriel : Christian Diot

Scientifiques

Sophie Allais
Nicolas Bédère (cv Hal)
Christian Diot (cv Hal)
Frédéric Hérault (cv Hal)
Sandrine Lagarrigue
Lætitia Lagoutte
Frédéric Lecerf
Pascale Le Roy
Romain Philippe

Technicien·ne·s
Bénédicte Lebez

Doctorant·e·s

Lorry Bécot (sujet de thèse)
Fabien Degalez (sujet de thèse)
Mathilde Doublet

Ils sont passés par l'équipe
Olivier Demeure
Colette Désert
Olivier Filangi
Jean-Marc Fraslin
Florian Herry (sujet de thèse ; thèse soutenue en 2019)
Frédéric Jehl (sujet de thèse; thèse soutenue en 2020)
Kévin Muret (sujet de thèse ; thèse soutenue en 2018)
David Picard-Druet (sujet de thèse ; thèse soutenue en 2020)
Hélène Romé (thèse soutenue en 2015)
Pierre-François Roux (thèse soutenue en 2014)
Chaker Sbai

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