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Les poissons présentent une étonnante diversité des systèmes de déterminisme du sexe, allant de déterminismes strictement génétiques à des systèmes fortement influencés par l’environnement. Chez les espèces possédant un déterminisme génétique monofactoriel, le déterminant majeur présent sur le chromosome sexuel est le gène responsable de l’initiation du processus de différenciation gonadique aboutissant à la formation des gonades mâles et femelles. Chez les poissons, en dépit d’efforts de recherche considérables, seul un déterminant majeur a été caractérisé chez le medaka, mais ce gène déterminant majeur n’est retrouvé que chez quelques espèces du même genre. Pour expliquer ce manque de connaissance sur les déterminants majeurs du sexe chez les poissons, l’hypothèse la plus probable suggère que les chromosomes sexuels des poissons, du fait de leur origine récente, aient émergé indépendamment dans différentes lignées, conduisant ainsi à une importante diversité des déterminants majeurs du sexe. Chez les salmonidés, famille importante d’un point de vue aquacole et environnemental, le système de détermination du sexe est de type XX/XY. Nous ont récemment identifié un gène que nous avons nommé SDY (Sexually Dimorphic on the Y) s’exprimant spécifiquement dans les gonades mâles embryonnaires de truite arc-en-ciel et strictement lié génétiquement au chromosome Y chez la truite arc-en-ciel et la truite commune, qui appartiennent à deux genres différents de salmonidés. Nos résultats suggèrent très fortement que SDY est le déterminant majeur du sexe chez ces deux espèces et peut-être d’autres salmonidés. Ce projet a donc pour principaux objectifs de (1) caractériser la fonction de SDY chez la truite arc-en-ciel, en vérifiant s’il s’agit bien d’un déterminant sexuel majeur et (2) étudier son évolution génomique et fonctionnelle au sein des salmonidés. Pour répondre à la première question, la différenciation de la gonade sera analysée chez des truites arc-en-ciel males inactivées pour SDY et des truites femelles sur-exprimant ce gène. La fonction biologique et les mécanismes d’action de la protéine SDY seront approfondis à travers sa caractérisation biochimique et la recherche des protéines partenaires avec la technique de double hybride. Les transcriptomes de lignées cellulaires transfectées avec SDY seront également analysés afin d’identifier les gènes régulés par SDY. Pour répondre à la seconde question, des cDNA homologues de SDY seront d’abord recherchés chez l’ombre commun et le lavaret, deux salmonidés éloignés de la truite arc-en-ciel, par séquençage NGS de transcrits de gonades en différenciation. Cette approche sera ensuite appliquée au brochet, espèce proche des salmonidés, pour rechercher l’existence d’homologues de SDY à l’extérieur de la famille des salmonidés. Les groupes de liaison porteurs du déterminant sexuel et de SDY seront identifiés et cartographiés chez l’ombre commun et le lavaret. Des banques de BAC de ces deux espèces seront criblées pour rechercher des séquences homologues de SDY et les BAC retenus seront utilisés pour caractériser, par FISH, les chromosomes sexuels des salmonidés et séquencés afin de décrire l’évolution génomique de cette région dans cette famille. L’identification du déterminant majeur du sexe de la truite arc-en-ciel sera un résultat d’importance majeure, compte tenu du très faible nombre d’espèces de vertébrés non mammaliens chez lesquelles un gène déterminant majeur du sexe a été caractérisé. D’un point de vue comparatif, ce projet aura un impact important sur notre vision actuelle des systèmes de déterminisme génétique du sexe chez les vertébrés en général et chez les salmonidés en particulier car la question d’un déterminant majeur du sexe unique reste l’objet d’un débat au sein de cette famille. Ce projet aura aussi des retombées pratiques importantes en offrant un outil de sexage génétique en aquaculture, écotoxicologie et écologie.

Partenaires :

• Inra LPGP, Rennes (Coordinateur Yann Guiguen)
• Inra, BIA - SIGENAE
• Inra GABI équipe GenAqua