En savoir plus

A propos des cookies

Qu’est-ce qu’un « cookie » ?

Un "cookie" est une suite d'informations, généralement de petite taille et identifié par un nom, qui peut être transmis à votre navigateur par un site web sur lequel vous vous connectez. Votre navigateur web le conservera pendant une certaine durée, et le renverra au serveur web chaque fois que vous vous y re-connecterez.

Différents types de cookies sont déposés sur les sites :

  • Cookies strictement nécessaires au bon fonctionnement du site
  • Cookies déposés par des sites tiers pour améliorer l’interactivité du site, pour collecter des statistiques

> En savoir plus sur les cookies et leur fonctionnement

Les différents types de cookies déposés sur ce site

Cookies strictement nécessaires au site pour fonctionner

Ces cookies permettent aux services principaux du site de fonctionner de manière optimale. Vous pouvez techniquement les bloquer en utilisant les paramètres de votre navigateur mais votre expérience sur le site risque d’être dégradée.

Par ailleurs, vous avez la possibilité de vous opposer à l’utilisation des traceurs de mesure d’audience strictement nécessaires au fonctionnement et aux opérations d’administration courante du site web dans la fenêtre de gestion des cookies accessible via le lien situé dans le pied de page du site.

Cookies techniques

Nom du cookie

Finalité

Durée de conservation

Cookies de sessions CAS et PHP

Identifiants de connexion, sécurisation de session

Session

Tarteaucitron

Sauvegarde vos choix en matière de consentement des cookies

12 mois

Cookies de mesure d’audience (AT Internet)

Nom du cookie

Finalité

Durée de conservation

atid

Tracer le parcours du visiteur afin d’établir les statistiques de visites.

13 mois

atuserid

Stocker l'ID anonyme du visiteur qui se lance dès la première visite du site

13 mois

atidvisitor

Recenser les numsites (identifiants unique d'un site) vus par le visiteur et stockage des identifiants du visiteur.

13 mois

À propos de l’outil de mesure d’audience AT Internet :

L’outil de mesure d’audience Analytics d’AT Internet est déployé sur ce site afin d’obtenir des informations sur la navigation des visiteurs et d’en améliorer l’usage.

L‘autorité française de protection des données (CNIL) a accordé une exemption au cookie Web Analytics d’AT Internet. Cet outil est ainsi dispensé du recueil du consentement de l’internaute en ce qui concerne le dépôt des cookies analytics. Cependant vous pouvez refuser le dépôt de ces cookies via le panneau de gestion des cookies.

À savoir :

  • Les données collectées ne sont pas recoupées avec d’autres traitements
  • Le cookie déposé sert uniquement à la production de statistiques anonymes
  • Le cookie ne permet pas de suivre la navigation de l’internaute sur d’autres sites.

Cookies tiers destinés à améliorer l’interactivité du site

Ce site s’appuie sur certains services fournis par des tiers qui permettent :

  • de proposer des contenus interactifs ;
  • d’améliorer la convivialité et de faciliter le partage de contenu sur les réseaux sociaux ;
  • de visionner directement sur notre site des vidéos et présentations animées ;
  • de protéger les entrées des formulaires contre les robots ;
  • de surveiller les performances du site.

Ces tiers collecteront et utiliseront vos données de navigation pour des finalités qui leur sont propres.

Accepter ou refuser les cookies : comment faire ?

Lorsque vous débutez votre navigation sur un site eZpublish, l’apparition du bandeau « cookies » vous permet d’accepter ou de refuser tous les cookies que nous utilisons. Ce bandeau s’affichera tant que vous n’aurez pas effectué de choix même si vous naviguez sur une autre page du site.

Vous pouvez modifier vos choix à tout moment en cliquant sur le lien « Gestion des cookies ».

Vous pouvez gérer ces cookies au niveau de votre navigateur. Voici les procédures à suivre :

Firefox ; Chrome ; Explorer ; Safari ; Opera

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de INRAE par email à cil-dpo@inrae.fr ou par courrier à :

INRAE
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2021

Menu Logo Principal Institut Agro Rennes Angers Univ R1 Logo Igepp

Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes

Logiciels

Liste des logiciels développés au sein de l'Igepp :

SimClone: forward simulations of diploid populations at increasing rates of clonality to analyse their relationships with clonal richness, distribution of clonal sizes, FIS and linkage disequilibrium.

Download source code (CC BY-NC-ND 3.0 FR)

Stoeckel, S., Porro, B., & Arnaud-Haond, S. (2019). Revising upward our appraisal of clonal rates in partially clonal organisms: the discernible and the hidden effects of clonality on the genotypic and genetic states of populations. ArXiv:1902.09365 [q-Bio] v4 peer-reviewed and recommended by Peer Community in Evolutionary Biology. Retrieved from https://arxiv.org/abs/1902.09365v4  doi: arXiv:1902.09365

https://zenodo.org/record/3666344

Contact: S. Stoeckel

ClonEstiMate 1.02

Becheler Ronan, Masson Jean-Pierre, Arnaud-Haond Sophie, Halkett Fabien, Mariette Stéphanie, Guillemin Maire-Laure, Valéro Myriam, Destombe Christophe, Stoeckel Solenn (2017). ClonEstiMate, a Bayesian method for quantifying rates of clonality of populations genotyped at two-time steps. Molecular Ecology Resources, 17, e251–e267. https://doi.org/10.1111/1755-0998.12698

Téléchargement du programme pour GNU/Linux

Téléchargement du programme pour Windows

Contact : S. Stoeckel

XPloidAssignment 1.0

Montecinos AE, Guillemin M-L, Couceiro L, Peters AF, Stoeckel S & Valero M (2017). Hybridization between two cryptic filamentous brown seaweeds along the shore: Analysing pre- and post-zygotic barriers in populations of individuals with varying ploidy levels. Molecular Ecology, Accepted manuscript online: 12 March 2017. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mec.14098/full

Téléchargement du programme pour GNU/Linux

Téléchargement du programme pour Windows

Contact : S. Stoeckel

Mamoth

Reichel, K., Bahier, V., Midoux, C., Parisey, N., Masson, J.-P. & Stoeckel, S. (2015). Interpretation and approximation tools for big, dense Markov chain transition matrices in population genetics. Algorithms for Molecular Biology, 10, 31. pdf

Téléchargement du programme

Contact : K. Reichel

Pasex

Stoeckel S. & Masson J.P. (2014). The Exact Distributions of FIS under Partial Asexuality in Small Finite Populations with Mutation. PLoS ONE, 9(1): e85228. pdf

Téléchargement du programme

Contact : S. Stoeckel