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Thèse débutée le 1er novembre 2018, soutenue le 13 juin 2022
Financement : Région Bretagne - INRA
Encadrants : Anne-Marie Chèvre, M. Rousseau

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Résumé : 

La recombinaison méiotique est un processus important en évolution, permettant la ségrégation correcte des chromosomes et le brassage des allèles à chaque génération, lors de la méiose. Ainsi, ce processus est très régulé. De manière intéressante, les allotriploïdes AAC de Brassica (2n=3x=29), issus du croisement entre Brassica napus (AACC, 2n=4x=38) et Brassica rapa (AA, 2n=2x=20), présentent une augmentation de la fréquence de crossovers (COs) et une modification de leur distribution comparé à B. rapa. Cependant, les causes de ces modifications restent à déterminer. Via l’utilisation de cartes génétiques et d’outils cytogénétiques, nous avons pu démontrer que ces modifications sont directement liées à la structure allotriploïde AAC. En effet, ce dernier présente plus de COs tout le long du génome, comparé à un diploïde AA mais aussi à un allotétraploïde AACC.  De plus, ce phénotype peut être conservé en seconde génération si la structure AAC est maintenue ou au contraire réversée si une structure AACC est retrouvée. Cependant, certaines régions génomiques restent dépourvues de recombinaison chez les hybrides testés. Nous avons pu démontrer que la méthylation de l’ADN et les variations structurales sont des facteurs limitants de la recombinaison chez le colza B. napus. Les inversions chromosomiques étant capables d’empêcher la formation de COs, y compris chez les AAC. L’étude fine de la recombinaison chez les allotriploïdes pourrait permettre d’identifier de nouveaux mécanismes régulant le profil de recombinaison. D’un point de vue appliqué, les AAC représentent un outil intéressant en sélection variétale, permettant par exemple d’accélérer les schémas de sélection ou l’introduction de caractères d’intérêts, y compris dans les régions péricentromériques.

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