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Thèse débutée le 1er décembre 2016, soutenue le 13 juillet 2020
Financement : CIFRE
Encadrant : Florence Val

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Résumé : 

L’induction des réponses de défense via la Pathogen-Associated Molecular Pattern (PAMP)-Triggered Immunity fournit à toutes les plantes un arsenal de composés antimicrobiens contre les agents pathogènes. La stimulation de ces défenses par des éliciteurs exogènes serait une stratégie pour réduire les pesticides mais ceci nécessite une meilleure compréhension des mécanismes d'induction. Cette induction pourrait dépendre de l'origine de l'éliciteur et du génotype. Deux génotypes de pomme de terre partiellement résistants à Phytophthora infestans ont été traités avec un PAMPs de P. infestans, un filtrat de culture concentré (CCF), une molécule synthétique, l’acide β-aminobutyrique (BABA) et un extrait d’Ulva spp. 48h après le traitement, les métabolites induits dans les folioles ont d’abord été comparés en métabolomique non ciblée via l’UPLC-qTOF-MS^e puis par des approches de métabolomique et transcriptomique ciblées. Les résultats ont montré que (i) chaque éliciteur induit une reprogrammation spécifique du métabolome : le BABA et le CCF ont induit les benzylisoquinoléine alcaloïdes et l'extrait d'Ulva, les stérols alcaloïdes et les phénylpropanoïdes ; (ii) l'analyse des transcrits a partiellement confirmé ces inductions; (iii) la signalisation dépend de la voie du JA pour l’extrait d'Ulva, et de la voie du SA pour le BABA et le CCF ; (iv) l’abondance de certains métabolites est génotype-dépendant. Nos résultats suggèrent que l’induction des composés antimicrobiens dépend de l'interaction éliciteur/génotype et de la perception spécifique de l’éliciteur. Afin d'améliorer leur efficacité sur le terrain, une attention particulière doit être portée à la signature métabolique de défense générée par chaque éliciteur.

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