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Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes

Articles 2020

Articles à comité de lecture publiés par l'équipe "Résistance et Adaptation" en 2020

Aigu Y., Cao T., Strelkov I. S., Manolii V. P., Lemoine J., Manzanares-Dauleux M. J., Strelkov S. E. & Gravot A. (2020). Identification of winter and spring Brassica napus genotypes with partial resistance to Canadian isolates of Plasmodiophora brassicae. Canadian Journal of Plant Pathology, on line.  https://doi.org/10.1080/07060661.2020.1723870

Botero-Ramírez A., Laperche A., Guichard S., Jubault M., Gravot A., Strelkov S. E. & Manzanares-Dauleux M. J. (2020). Clubroot Symptoms and Resting Spore Production in a Doubled Haploid Population of Oilseed Rape (Brassica napus) Are Controlled by Four Main QTLs. Frontiers in Plant Science, 11(1998).  https://doi.org/10.3389/fpls.2020.604527

Bousset L., Ermel M. & Delourme R. (2020). French condiment mustard resistance against Leptosphaeria maculans relies on genes Rlm5 and Rlm6, calling for caution in the deployment of Rlm6 in oilseed rape crops. European Journal of Plant Pathology, on line.  https://doi.org/10.1007/s10658-020-02099-2

Clin P., Grognard F., Mailleret L., Val F., Andrivon D. & Hamelin F. (2020). Taking advantage of pathogen diversity and immune priming to minimize disease prevalence in host mixtures: a model. Phytopathology, on line.  https://doi.org/10.1094/phyto-09-20-0429-r

Daval S., Gazengel K., Belcour A., Linglin J., Guillerm-Erckelboudt A.-Y., Sarniguet A., Manzanares-Dauleux M. J., Lebreton L. & Mougel C. (2020). Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes. Microbial Biotechnology, on line.  https://doi.org/10.1111/1751-7915.13634

Dutt A., Andrivon D., Leclerc M., Le Roy G., Jumel S., Baranger A. & Le May C. (2020). Life history traits and trade‐offs between two species of the Ascochyta blight disease complex of pea. Plant Pathology, 69, 1108–1124.  https://doi.org/10.1111/ppa.13180

Esquibet M., Gautier C., Piriou C., Grenier E., Fournet S. & Montarry J. (2020). Evidence of strong gene flow among French populations of the carrot cyst nematode Heterodera carotae. Plant Pathology, 69(1), 168–176.  https://doi.org/10.1111/ppa.13102
Gautier C., Fournet S., Piriou C., Renault L., Yvin J. C., Nguema-Ona E., Grenier E. & Montarry J. (2020). Plant-parasite coevolution: a weak signature of local adaptation between Peruvian Globodera pallida populations and wild potatoes. Ecology and Evolution, 10, 4156–4163.  https://doi.org/10.1002/ece3.6248

Gautier C., Martinez L., Fournet S., Montarry J., Yvin J. C., Nguema-Ona E., Guillerm-Erckelboudt A. Y., Piriou C., Linglin J., Mougel C. & Lebreton L. (2020). Hatching of Globodera pallida induced by root exudates is not influenced by soil microbiota composition. Frontiers in Microbiology, 11, 536932.  https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.536932

Gazengel K., Lebreton L., Lapalu N., Amselem J., Guillerm-Erckelboudt A. Y., Tagu D. & Daval S. (2020). pH effect on strain-specific transcriptomes of the take-all fungus. PLoS ONE, 15(7), e0236429.  https://doi.org/10.1371/journal.pone.0236429

Gourrion A., Simon C., Vallée P., Delourme R., Chatre S. & Dheu J. E. (2020). Enlarging the genetic diversity of winter oilseed rape (WOSR) by crossing with spring oilseed rape (SOSR). OCL - Oleagineux, Corps Gras, Lipides, 27, 16.  https://doi.org/10.1051/ocl/2020013

Guinot F., Szafranski M., Chiquet J., Zancarini A., Le Signor C., Mougel C. & Ambroise C. (2020). Fast Computation of Genome-Metagenome Interaction Effects. Algorithms for Molecular Biology, 15(1), e13.  https://doi.org/10.1186/s13015-020-00173-2

Guyomar C., Delage W., Legeai F., Mougel C., Simon J.-C. & Lemaitre C. (2020). MinYS: Mine Your Symbiont by targeted genome assembly in symbiotic communities. [bioRxiv:2019.12.13.875021]. NAR Genomics and Bioinformatics, 2(3).  https://doi.org/10.1093/nargab/lqaa047

Hackenberg D., Asare-Bediako E., Baker A., Walley P., Jenner C., Greer S., Bramham L., Batley J., Edwards D., Delourme R., Barker G., Teakle G. & Walsh J. (2020). Identification and QTL mapping of resistance to Turnip yellows virus (TuYV) in oilseed rape, Brassica napus. Theoretical and Applied Genetics, 133, 383–393.  https://doi.org/10.1007/s00122-019-03469-z

Handayani N. D., Esquibet M., Montarry J., Lestari P., Couvreur M., Dikin A., Helder J., Grenier E. & Bert W. (2020). Distribution, DNA barcoding and genetic diversity of potato cyst nematodes in Indonesia. European Journal of Plant Pathology, on line.  https://doi.org/10.1007/s10658-020-02078-7

Jacquiod S., Puga-Freitas R., Spor A., Mounier A., Monard C., Mougel C., Philippot L. & Blouin M. (2020). A core microbiota of the plant-earthworm interaction conserved across soils. [bioRxiv, 571240.  https://doi.org/10.1101/571240]. Soil Biology and Biochemistry, 144, 107754.  https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.107754

Katsoulas N., Løes A. K., Andrivon D., Cirvilleri G., de Cara M., Kir A., Knebl L., Malińska K., Oudshoorn F. W., Willer H. & Schmutz U. (2020). Current use of copper, mineral oils and sulphur for plant protection in organic horticultural crops across 10 European countries. Organic Agriculture, on line.  https://doi.org/10.1007/s13165-020-00330-2

Laloum Y., Ngala B. M., Lanszen M., Boulogne I., Plasson C., Fournet S., Gotte M., Nguema-Ona E., Leroux A. C., Gobert V., Driouich A. & Vicré M. (2020). A novel in vitro tool to study cyst nematode chemotaxis. Frontiers in Plant Science, 11, 1024.  https://doi.org/10.3389/fpls.2020.01024

Le May C., Montarry J., Morris C. E., Frenkel O. & Ravigné V. (2020). Editorial: Plant Pathogen Life-History Traits and Adaptation to Environmental Constraints. Frontiers in Plant Science, 10(1730).  https://doi.org/10.3389/fpls.2019.01730

Lopes-Martin R., Le Boulch P., Clin P., Schwarzenberg A., Yvin J. C., Andrivon D., Nguema-Ona E. & Val F. (2020). A comparison of PTI defense profiles induced in Solanum tuberosum by PAMP and non-PAMP elicitors shows distinct, elicitor-specific responses. PLoS ONE, 15(8), e0236633.  https://doi.org/10.1371/journal.pone.0236633

Montarry J., Mimee B., Danchin E., Koutsovoulos G., Ste Croix D. & Grenier E. (2020). Recent advances in population genomics of plant-parasitic nematodes. Phytopathology, ??  https://doi.org/10.1094/phyto-09-20-0418-rvw

Omri Benyoussef N., Chaar H., Bessaidi Z., Halila I., Jammezi N., Mbazia A., Kharrat M. & Le May C. (2020). Temporal and spatial dynamics of ascochyta blight caused by Ascochyta fabae Spreg. in faba bean fields in Tunisia. Australian Journal of Phytopathology, on line.

Ourry M., Lopez V., Hervé M., Lebreton L., Mougel C., Outreman Y., Poinsot D. & Cortesero A. M. (2020). Long lasting effects of antibiotics on bacterial communities of adult flies. FEMS Microbiology Ecology, 96(4).  https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa028

Quillévéré-Hamard A., Le Roy G., Lesné A., Le May C. & Pilet-Nayel M. L. (2020). Aggressiveness of diverse  French Aphanomyces euteiches isolates on pea Near-Isogenic-Lines differing in resistance QTL. Phytopathology, accepted.  https://doi.org/10.1094/PHYTO-04-20-0147-R

Rochefort A., Simonin M., Marais C., Guillerm-Erckelboudt A.-Y., Barret M. & Sarniguet A. (2020). Asymmetric outcome of community coalescence of seed and soil microbiota during early seedling growth. bioRxiv, 2020.2011.2019.390344.  https://doi.org/10.1101/2020.11.19.390344

Rousseau-Gueutin M., Belser C., Da Silva C., Richard G., Istace B., Cruaud C., Falentin C., Boideau F., Boutte J., Delourme R., Deniot G., Engelen S., Ferreira de Carvalho J., Lemainque A., Maillet L., Morice J., Wincker P., Denoeud F., Chèvre A.-M. & Aury J.-M. (2020). Long-reads assembly of the Brassica napus reference genome, Darmor-bzh. GigaScience, 9(12).  https://doi.org/10.1093/gigascience/giaa137

Stomph T., Dordas C., Baranger A., Bedoussac L., de Rijk J., Dong B., Evers J., Gu C., Li L., Simon J., Jensen E. S., Wang Q., Wang Y., Wang Z., Xu H., Zhang C., Zhang L., Zhang W. P. & van der Werf W. (2020). Designing intercrops for high yield, yield stability and efficient use of resources: are there principles? Advances in Agronomy, 160(1), 1-50.  https://doi.org/10.1016/bs.agron.2019.10.002

Thevenoux R., Folcher L., Esquibet M., Fouville D., Montarry J. & Grenier E. (2020). The hidden diversity of the potato cyst nematode Globodera pallida in the south of Peru. Evolutionary Applications, 13(4), 727-737.  https://doi.org/10.1111/eva.12896

Veillet F., Durand M., Kroj T., Cesari S. & Gallois J.-L. (2020). Precision breeding made real with CRISPR: illustration through genetic resistance to pathogens. Plant Communications, 1(5), 100102.  https://doi.org/10.1016/j.xplc.2020.100102

Veillet F., Kermarrec M.-P., Chauvin L., Chauvin J.-E. & Nogué F. (2020). CRISPR-induced indels and base editing using the Staphylococcus aureus Cas9 in potato. PLoS ONE, 15(8), e0235942.  https://doi.org/10.1371/journal.pone.0235942

Veillet F., Perrot L., Guyon-Debast A., Kermarrec M.-P., Chauvin L., Chauvin J.-E., Gallois J.-L., Mazier M. & Nogué F. (2020). Expanding the CRISPR Toolbox in P. patens Using SpCas9-NG Variant and Application for Gene and Base Editing in Solanaceae Crops. International Journal of Molecular Sciences, 21(3), 1024.  https://doi.org/10.3390/ijms21031024